Каждый номер журнала "Компьютерные учебные программы и инновации" в 2006 году содержал компакт диск.
№1
Диск Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Ставропольский государственный университет», Ставропольского отделения отраслевого фонда алгоритмов и программ
№2
Диск Негосударственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Международный Гуманитарно-Лингвистический Институт»
№3
Диск «Multimedia Technologies & Distance Learning», Ltd
№4
Диск Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Дальневосточный государственный университет», Дальневосточного отделения отраслевого фонда алгоритмов и программ
№5-6
Диск Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Воронежский государственный архитектурно-строительный университет», Воронежского отделения отраслевого фонда алгоритмов и программ
№7
Диск Государственного образовательного учреждения Гимназия N 1526 (г. Москва)
№8
Диск Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Башкирский государственный университет», Башкирского отделения отраслевого фонда алгоритмов и программ
№9
Диск Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Липецкий государственный технический университет», Липецкого отделения отраслевого фонда алгоритмов и программ
№10
Диск Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Оренбургский государственный университет», Оренбургского отделения отраслевого фонда алгоритмов и программ
№11
Диск Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Якутский государственный университет им. М.К. Аммосова», Якутского отделения отраслевого фонда алгоритмов и программ
№12
Диск ФГНУ «Государственный координационный центр информационных технологий», отраслевого фонда алгоритмов и программ