Вопрос: "...как было бы правильно ссылаться на полученный сертификат о регистрации электронного ресурса?

Ответ: "Вот пример ссылки, которую принимают в журналах Скопус:
Галкина А.И., Гришан И.А. Электронный информационный ресурс «Информационный портал ОФЭРНиО» /М.: ОФЭРНиО. 2010. № 15655. 21.04.2010."